20
Nov
Posted in Biotechnology by admin |
Source: bitesizebio.com by Nick
Antibiotics are used in a wide range of techniques in molecular biology. My aim with this post is to provide an easy reference to some of the main antibiotics used in molecular biology, their mechanisms, range and working concentrations.
| Antibiotic |
Class |
Range |
Mechanism |
Resistence confered by |
Conc (ug/ml) |
| Ampicillin |
Beta-lactam |
Gm+, Gm- |
Inhibits transpeptidase required for cell wall synthesis |
Beta-lactamase. Cleaves the beta-lactam ring of amphicillin |
100 – 200 |
| Amphotericin B |
|
Ye, Fu, My |
Complexes with cholesterol, forming a pore that allows leakage of glucose |
|
2.5 |
| Carbenicillin |
Beta-lactam |
Gm+, Gm- |
As for ampicillin |
As for ampicillin, but carbenicillin is broken down more slowly by beta-lactamase |
100 |
| Chloramphenicol |
|
Gm+, Gm- |
Binds to ribosomal 50S subunit, preventing peptidyl transferase required for translation |
Chloramphenicol acetyltransferase adds an acetyl group to form AcoA to chloramphenicol, with inactivates it |
5 – 10 |
| Erythromycin |
Macrolide |
Gm+, Gm- |
Similar to chloramphenicol |
ermC methyltransferase mythylates the 23S rTNA, preventing erythromycin binding to the ribosome |
100 |
| Kanamycin |
Aminoglycoside |
Gm+, Gm-, My |
Binds to the 30S ribosomal sub-unit, blocking the initiation complex and causing frame-shift mutations and inhibition of translation |
Kanamycin phosphotransferase effects the ATP dependent phosphorylation of hydroxyl residues on kanamycin |
100 |
| Gentamycin |
Aminoglycoside |
Gm+, Gm- |
Similar to kanamycin |
Gentamycin acetyltransferase; mechanism similar to chloramphenicol acetyltransferase |
25 – 50 |
| Neomycin |
Aminoglycoside |
Gm+, Gm- |
Similar to kanamycin |
Neomycin phosphotransferase; mechanism similar to kanamycin phosphotransferase |
25 – 50 |
| Nystatin |
|
Ye, Fu |
Similar to amphotericin B |
|
50 |
| Rifampicin (rifampin) |
Semi-synthetic |
Gm+, Gm- |
Inhibits DNA dependent RNA polymerase, preventing transcription |
|
50 |
| Streptomycin |
Aminoglycoside |
Gm+, Gm- |
Binds to 16S ribosomal sub-unit, preventing initiation on translation |
Streptomycin 3’-adenyltransferase transfers the adenyl group from ATP onto streptomycin |
50 |
| Tetracycline |
Tetracyclin |
Gm+, Gm- |
Prevents aminoacyl tRNA from binding to 30S sub-unit |
TetR-TN10 gene encodes an inner membrane protein that pumps tetracycline out of the cell |
50 |
*Abbreviations: Gm(+/-)=Gram positive/negative; My=mycoplasma; F=fungus; Y=yeast.
16
Oct
Posted in Health Care, Sosialita by yepyhardi |

Read more… »
15
Oct
Posted in Mobile Internet by yepyhardi |
Bagi Anda yang hobi berinternet mobile sekaligus pencinta Firefox untuk browser di desktop/laptop, berita akan hadirnya Firefox Mobile tentu saja sangat menggembirakan. Dengan pengguna aktif sebanyak 160 juta, langkah Mozilla melahirkan “bayi” mobile yang diberi kode Fennec ini terbilang sangat lambat, mengingat para pesaingnya sudah eksis terlebih dahulu di dunia mobile. Sebut saja Opera Mini, Safari untuk iPhone dan IE mobile yang terintegrasi dengan Windows Mobile. Firefox versi alpha akan diluncurkan akhir bulan Oktober 2008 ini guna menjalani pengujian dan pengembangan berbagai extension oleh para developer.
Sebagaimana versi desktop, Firefox mobile juga bersifat open source, siapa saja bisa mengembangkan extension-extension yang menjadi salah satu kekuatan utama Firefox. Hebatnya lagi, Anda dapat mensinkronisasi bookmarks, history dan extension antara Firefox Mobile dengan Firefox desktop. So, nggak perlu repot-repot membuat bookmark atau menginstall extension dua kali.
Antar mukanya sendiri tergolong sederhana, hanya ada jendela broswer dengan address bar, ditambah tombol-tombol navigasi back dan forward, bookmark, serta tombol tabs yang memungkinkan kita melihat preview hingga 4 tab yang sedang terbuka untuk mempermudah perpindahan antar tab. Fitur ini merupakan salah satu kelebihannya ketimbang Safari-nya iPhone. Firefox mobile akan memiliki versi untuk perangkat yang touchscreen (PDA & iPhone) maupun yang non-touchscreen (smartphone/handphone).
Anda tertarik berpindah ke Firefox mobile atau setidaknya mencoba terlebih dahulu? Harap bersabar, kabarnya browser mobile ini baru dirilis awal tahun 2009 mendatang. [yepy]
15
Oct
Posted in Biotechnology, Internet by admin |
Mencari literatur ilmiah saat ini tidak sesulit dulu. Adanya internet mempermudah orang untuk mencari atau berbagi informasi apa saja, termasuk literatur ilmiah. Kalau di tahun 90-an literatur ilmiah seperti jurnal hanya bisa didapatkan di perpustakaan-perpustakaan –itu pun belum tentu lengkap, kini dengan duduk rileks di depan komputer, literatur dengan mudah didapat, asalkan ada jaringan internet. Setelah sedikit nanya sama Om Google, dengan beberapa kali klik literatur sudah di tangan (maksudnya di harddisk).
Semudah itu? Ternyata tidak juga. Memang sih ribuan bahkan jutaan literatur bertebaran di internet, tapi bagaimana cara kita memilah literatur mana yang benar-benar kita perlukan? Nggak mungkin kita mengunduh (mendownload –red) semua literatur dan membacanya satu per satu. Barangkali Om Google bisa membantu memilah asalkan kita menuliskan kata kunci (keyword) pencarian yang tepat, apalagi dengan adanya Google Scholar yang mengkhususkan pencarian referensi ilmiah di internet. Namun rasanya itu saja belum cukup, masih terlalu banyak hasil pencarian yang mesti kita pilah-pilah.
Read more… »
14
Oct
Posted in Aktualita, Green Earth by admin |
Menurut berita yang dilansir www.detik.com, permukaan laut bisa naik hingga 1 meter pada tahun 2100! Hal ini akibat dampak pemanasan global yang terjadi karena efek rumah kaca, terutama dengan terus dibangunnya stasiun energi.
Menurut Schellnhuber, kepala Potsdam Institute for Climate Impact Research (PIK), gejala-gejalanya sudah nampak dari mencairnya salju di Himalaya dan lempengan es di Greenland hingga tiga kali lebih cepat dari sebelumnya.
Hii…ngerinya…, kantorku di pinggir pantai Ancol bisa kerendem nih!
27
Sep
Posted in Health Care, Sosialita by admin |
Oleh: Taufiq Ismail
Indonesia adalah sorga luar biasa ramah bagi perokok, tapi tempat siksa tak tertahankan bagi orang yang tak merokok,
Di sawah petani merokok, di pabrik pekerja merokok, di kantor pegawai merokok, di kabinet menteri merokok, di reses parlemen anggota DPR merokok, di Mahkamah Agung yang bergaun toga merokok, hansip-bintara- perwira nongkrong merokok, di perkebunan pemetik buah kopi merokok, di perahu nelayan penjaring ikan merokok, di pabrik petasan pemilik modalnya merokok, di pekuburan sebelum masuk kubur orang merokok,
Indonesia adalah semacam firdaus-jannatu- na’im sangat ramah bagi perokok, tapi tempat siksa kubur hidup-hidup bagi orang yang tak merokok,
Read more… »
27
Sep
Posted in Health Care by admin |
Sumber: Sumber: Intisari - Agustus 1998
Gambar: http://www.mymanmitt.com
“Penyakit” lupa makin perlu diwaspadai sebab, seperti yang dilansir oleh The Straits Times (TST), edisi 9 Januari 1998, otak generasi tahun 50-an yang kini mulai menginjak usia paruh baya, mengalami kemunduran. Apa penyebab kemunduran itu dan bagaimana solusinya? Klinik Memori maupun pelbagai suplemen ditawarkan untuk membantu.
Sungguh keterlaluan sifat pelupa Peter (27). Setiba di rumah kontrakannya sehabis berbelanja, ia kaget setengah mati. Soalnya mobilnya tak terparkir digarasi. Ia lalu bertanya kepada teman-temannya, apakah ada yang melihat siapa yang memakai mobilnya. Ia semakin bingung karena tak memperoleh jawaban. Mereka baru saja pulang dan mobilnya sudah tidak ada di garasi. Ketika seorang teman bertanya, ia dari mana dan Peter menjawab baru dari BIP (sebuah pusat perbelanjaan di Bandung), ia langsung disambar dengan pertanyaan, “Naik apa?” Peter langsung memukul jidatnya. Segera ia balik ke BIP untuk mengambil mobilnya yang masih berada di tempat parkir BIP.
Read more… »
24
Sep
Posted in Internet by admin |
Siapa sih yang gak pernah pake Internet Messenger alias Messenger alias IM itu? IM kini sudah lumrah dan menjadi salah satu alternatif alat komunikasi murah meriah (tapi gak pake mencret :p). Kita cukup punya koneksi internet dan account di salah satu penyedia jasa IM, dan bebaslah kita berkomunikasi dengan siapa saja yang juga terhubung dengan jaringan IM tadi. Selain tentu saja ngobrol, IM juga bisa dijadikan sebagai sarana bertukar file seperti foto, musik, atau apapun (tentu saja kalo koneksi internetnya mendukung). Pamor IM boleh dibilang bisa disandingkan dengan email yang sudah duluan kondang, meskipun masing-masing punya keunggulan dan kelemahannya. IM lebih cocok untuk keperluan komunikasi dua arah secara instant atau realtime, karena kedua pihak yang berkomunikasi sedang online dalam waktu yang bersamaan, sehingga pesan yang disampaikan bisa langsung di-reply. Sedangkan Email lebih cocok untuk menyampaikan sesuatu yang masif, tidak memerlukan reply secara realtime, bahkan bisa dipakai untuk keperluan komunikasi resmi.
Read more… »
5
Sep
Posted in Just Relax by admin |
How often do you change your socks? If you always use the same socks for a whole week, please consider to edify your habit by looking at the following pictures.

Read more… »